Načelo filtriranja filtrirnih medijev temelji predvsem na fizičnem prestrezanju, adsorpciji, presejalnem in inercialnem trku.
Fizično prestrezanje pomeni, da suspendirani delci v vodi blokirajo pore filtrirnega medija in jih zadržijo na površini ali znotraj filtrirnega medija. Filtrirni mediji imajo običajno določeno strukturo por. Ko voda teče skozi filtrirno plast, se drobni delci prestrežejo, ker je njihova velikost večja od pore.
Adsorpcija ima tudi pomembno vlogo v postopku filtracije. Površina filtrirnega medija ima določeno adsorpcijsko sposobnost, ki lahko adsorbira nekaj topnih organskih snovi, koloidov in drugih nečistoč, tako da jih prestrežejo s filtrirnimi mediji.
Načelo presejanja je podobno vlogi sita. Filtrirni mediji različnih velikosti delcev imajo pore različnih velikosti, ki lahko v vodi pregledajo delce različnih velikosti delcev, prestrežejo večje nečistoče v zgornjem delu filtrirne plasti in postopoma prodrejo v manjše nečistoče v filtrirno plast.
Inercialni trk pomeni, da ko imajo delci v pretoku vode določeno inercijo, ko naletijo na pore ali površino filtrirnega medija, odstopajo od smeri pretoka vode zaradi vztrajnosti in s tem stopijo v stik z filtrirnimi mediji in jih prestrežejo.
